Трансформация App.config

Вариант1
1) Создать необходимые конфигурации для проекта, если таковые отцутствуют. (Debug, Release, Test and others)
2) Указать в файле проекты файлы конфигурации (Для удобного отображения в проекте)
3) Указать в фале проекта импорт модуля трансформации
4) Указать в файле проекта задачу, выполняющую трансформацию

Трансформация будет выполняться перед сборкой решения.
Исходным файл: App.Base.config
Конечный файл: App.config
Применяемая трансформация: App.<Name>.config

Вариант2
SlowCheetah

добавляет поддержку трансформации .config файлов под текущие конфигурации на уровне VisualStudio

Расширение добавляет возможность сгенерировать файлы конфигурации в проекте (не обязательно)
Nuget пакет используется при выполнении сборки (обязательно)

Ссылки:
https://www.nuget.org/packages/Microsoft.VisualStudio.SlowCheetah/
https://marketplace.visualstudio.com/items?itemName=vscps.SlowCheetah-XMLTransforms